La chiesa, che si trova sulla Corredera baja de San Pablo fu progettata nel 1624 dall’architetto gesuita Pedro Sánchez e da Juan Gómez de Mora ed edificata nel 1633. Pur se rinnovata nell’Ottocento, la chiesa mantiene ancora l’originale armonia e la linearità della facciata, dovuta forse al fatto che era destinata a servire da ospedale per i sudditi portoghesi della corona spagnola. In seguito, e a questo deve il suo nome, San Antonio fu adibita, per volere della moglie di Filippo IV, a ospedale per i Tedeschi. L’interno è decorato da splendidi affreschi di Francisco Ricci e Juan Carreño.
